Letak dan Luas Wilayah Desa Jogonegor, Desa Jogonegoro secara administratif masuk ke dalam wilayah Kecamatan Mertoyudan, Kabupaten Magelang, terletak di arah barat laut dari Ibu Kota kabupaten Magelang kurang lebih berjarak 8 Km dan 5 Km dari Kantor Kecamatan Mertoyudan, Waktu tempuh untuk menuju ke Kantor Kecamatan mertoyudan sekitar 15 menit dan waktu tempuh ke Ibu Kota Kabupaten Magelang kurang lebih 20 menit.
Desa Jogonegoro memiliki konfigurasi dataran dengan ketinggian antara 293 - 300 m dari permukaan laut (DPL), sehingga digolongkan sebagai dataran sedang dengan hawa sejuk. Luas Desa Jogonegoro kurang lebih ada 300 Ha dengan pembagian penggunaan lahan sebagai berikut:
- Tanah sawah seluas 174.638 H
- Tanah Kering atau tegalan seluas 64.402 Ha.
- Pemukiman seluas 42.095 Ha.
- Fasilitas Umum ada seluas 25 Ha.
Desa Jogonegoro terdiri dari 9 Dusun, 4 Komplek perumahan dan 56 RT:
- Dusun Punduhan RW. I, 5 Rukun Tetangga (RT).
- Dusun Pringtali RW.II, 7 Rukun Tetangga (RT).
- Dusun Sogaten RW. III, 2 Rukun Tetangga (RT).
- Dusun Jetakan RW. IV, 4 Rukun Tetangga (RT).
- Dusun Jogopranan RW. V, 4 Rukun Tetangga (RT).
- Dusun Soroyudan RW. VI, 2 Rukun Tetangga (RT).
- Dusun Saren RW. VII, 2 Rukun Tetangga (RT).
- Dusun Kemaran RW. VIII, 3 Rukun Tetangga (RT).
- Dusun Honggosari RW. IX, 4 Rukun Tetangga (RT).
- Perum. Jogonegoro Indah I RW. X, 9 Rukun Tetangga (RT).
- Perum. Jogonegoro Indah II RW. XI, 9 Rukun Tetangga (RT).
- Perum. Griya Sekar Tanjung RW. XII, 2 Rukun Tetangga (RT).
- Perum. Laguna Residence RW. XIII, 3 Rukun Tetangga (RT).
Batas- Batas Desa Jogonegoro:
- Batas Sebelah Utara adalah Desa Banjarnegoro.
- Batas Sebelah Selatan adalah Desa Kalinegoro.
- Batas sebelah barat Sungai Progo (Kecamatan Tempuran).
- Batas sebelah timur yaitu Desa Sukorejo.